本所自1953年由錢穆先生創辦後，為培養中國文史哲人才，繼𠄘及發揚中國文化，於1955年正式招生. 本所導師自創辦期由錢穆、唐君毅、牟潤孫、謝幼偉、潘重規諸先生，以至續聘牟宗三、徐復觀、全漢昇、嚴耕望、王德昭、陳荊和、汪經昌、羅夢冊諸先生，皆為學林祭酒, 名聞於海內外. 故各地醉心中國文史哲青年，投考者眾，遂成為港、台及海外培訓中國文史哲的重要教學基地。本所歷年所培訓的新一代文史哲學者，此後相繼任教海內外各大學，並成爲著名專家學者，由是享譽海內外。

本所成立之初，招收員生，於修業期滿後，由香港中文大學新亞書院新亞研究所頒發結業證書。迨至1974年因脱離香港中文大學，獨自辦學，遂改由台灣教育部頒發碩士學位，至1981年獲教育部准開博士課程, 此後招收碩博士至今，於2024-2025學年暫行停招。改由儒學史研究中心招收中國文史哲研究生學習員。並由本所原有導師李學銘、林啟彥、周佳榮、李金強、何廣棪、盧雪崑、吳明等任教。此外，本所聘有校外著名專家學者為榮譽教授，協助教學及指導、審閱畢業論文。

本研究班屬研究生課程，申請入學者，必須具有國內外大專文科及認可科系之畢業生

規定兩年為修業期

兩年需修習十二科及撰寫結業論文；每科可得2學分，合計24學分

第一年修畢六科後；第二年開始撰寫結業論文

修畢學分及通過所撰論文後，由新亞研究所頒發結業證書

學費每年港幣15，000元

中國文史哲研究班課程，設獎助學額三名，供成績優異者

入學者須具等同大專學歷程度

旁聽生收費每科港幣2，300元

旁聽生若修畢12科，亦可申請轉為正式之中國文史哲研究班學生，須加寫論文；論文如未獲通過，已繳交之旁聽生學費，概不發還